Fortsat afbudsramte Bayern München gjorde et hæderligt forsøg, men Inter er klar til Champions Leagues semifinaler.
Det står klart efter 2-2 i Milano onsdag aften og dermed 4-3 samlet.
Harry Kane udlignede den italienske føring i en underholdende anden halvleg, men to hurtige scoringer efter hjørnespark skabte eufori på Giuseppe Meazza, inden Eric Dier med sit mål skabte en højintens afslutning.
Bayern var igen uden Manuel Neuer, Alphonso Davies, Dayot Upamecano og Jamal Musiala, og især sidstnævnte havde pyntet i et opgør, hvor tyskerne manglede den sidste kreativitet og skarphed.
Som i 2009/10-sæsonen, hvor Inter vandt sin tredje og senest europæiske mesterskabstitel, skal holdet op mod FC Barcelona i semifinalerne.
Første slag står i Barcelona om to uger, inden Giuseppe Meazza danner ramme om returmødet en uge senere.
Ligesom i München tog Bayern fat i kuglen fra første fløjt, mens Inter omvendt gerne ville bryde tyskernes spil og spille hurtige omstillinger.
Det begyndte lidt vaklende for værterne, da der var adskillige huller i den italienske defensiv. Til gengæld var forsvarsspillernes individuelle niveau tårnhøjt, og kastanjerne blev med bravur reddet ud af ilden i flere omgange.
Siden havde Inter en lovende periode offensivt med et par nærgående forsøg, inden Bayern sluttede bedst af inden pausen.
Thomas Müller og Leroy Sane fik begge ram på målrammen, men den tidligere Bayern-reserve Yann Sommer var vågen og holdt scoren på 0-0 ved sideskiftet.
Hvad første halvleg manglede målmæssigt, kom straks efter genstarten, hvor chancerne flød i begge ender.
Bayern skabte balance i det samlede regnskab, da Harry Kane fandt vej gennem Federico Dimarcos ben og sendte kuglen i nettet uden for Sommers rækkevidde.
Men Inter svarede hurtigt tilbage. Lautaro Martínez fik to forsøg efter Dimarcos hjørnespark, og efter at have kikset med hovedet var argentineren anderledes resolut med højrebenet.
Få minutter senere blev det også 2-1 og 4-2 samlet, da forsvarsspilleren Benjamin Pavard kraftfuldt pandede Hakan Calhanoglus hjørnespark fra den modsatte side ind bag den unge Bayern-vikar Jonas Urbig.
Bayern var tvunget i offensiven, og efter 75 minutter gav det pote, og igen var det efter et hjørnespark.
Tyskerne spillede det kort, og efter Serge Gnabrys indlæg headede den engelske stopper Eric Dier nærmest fra baglinjen bolden i en bue over Sommer og i nettet.
Det tyske pres var enormt i slutfasen, og både Kane, Thomas Müller og Kingsley Coman kom frem til muligheder, men Inters overlevelseskamp endte med sort/blå jubel.
/ritzau/
TOPNYHED Denne Superliga-kamp droppet på TV
NYHEDER
Tøfting revser Superligaklub: ‘For nonchalant!’
Her er FCM’s vej til Europa League-finalen
Hjulmand blev vraget – nu forklarer træneren
EKSKLUSIVT
Helt sikker: ‘Uundgåeligt – det sker til sommer’
NYHEDER
Vil gøre det onde ved Brøndby
Stats til Superligaen: Kæmpe overpræstation
NYHEDER Hvem kommer i top-6? Her er alle scenarierne
EKSKLUSIVT
Ekspert: De rykker op i Superligaen
NYHEDER
Nu svarer Pochettino på Tottenham-jobbet
EKSKLUSIVT
Bekræfter: Afviser FC Nordsjælland
TOPNYHED
Skrækkeligt af Dominik Sarapata
INTERVIEW
Rørt Wass: ‘Det betyder rigtig meget for mig’
TOPNYHED ‘Absolut ingen tvivl’ om Thomas Franks fremtid
NYHEDER
Frimann i rørende farvel: ‘Utroligt trist dag’
TRANSFER
Henter 16-årig i FC København
– Fyringen af Jess Thorup var uforståelig for mig
INTERVIEW
Vallys jubler over mirakel: ‘Det er fedt!’
Dommer-ekspert i chok: Fuldkommen grotesk!
Bekræfter: Dansk klub i choktransfer
EKSKLUSIVT
Afsløring: Brøndby forhandler om Lauritsen
HELT VILDT
Froholdt-video trækker overskrifter
HELT VILDT
Vild melding: City kan få fratrukket 60 point
NYHEDER
Stort medie langer ud efter Jens Stage
NYHEDER
Dansker i centrum for drama: ‘En skandale!’
NYHEDER
Peger på FCK: ‘Det er pinligt’
Sker det? ‘Vil tage røven på os alle sammen’
NYHEDER
Skal Schmeichel spille? Nu svarer Riemer
TRANSFER
Bekræfter kæmpe Brøndby-bud
NYHEDER
Kaldt en flok ‘skoledrenge’ – nu reagerer Eriksen
NYHEDER
Kontant melding fra ny Spurs-boss
EKSKLUSIVT
FC Nordsjælland reagerer på afvisning
Medier hylder Nørgaard: Vidunderligt – topspiller!
Lyngby på jagt efter uventede spillersalg
Legender tager afsked med Sepp Piontek
Liverpool – West Ham United
NYHEDER
Første gang nogensinde for Eriksen
HELT VILDT
Ikke i tvivl: ‘Ville være brutalt!’
Har ikke hørt fra Riemer siden sidste sæson
NYHEDER
Dem kan FCM trække i Europa League
Kasper Hjulmand brager ind i Arsenal
TOPNYHED
Lykkelige omstændigheder – 4 profiler tvivlsomme
Officielt: Victor Lind i rekordhandel
‘Han kan blive den nye Rasmus Højlund’
‘Jeg hadede verden’
NYHEDER
Ekspert: ‘Tror han kommer til at stå!’
NYHEDER
Her er FC Midtjyllands modstander i Europa League
Dommerekspert om FCN-sag: Så er det en skandale
DAGENS SPILFORSLAG
Augsburg kan tæve Gedebukke
‘Han er tilgivet’
NYHEDER
FCM-profil – Riemer har ikke ringet
AGF-profil: ‘Jeg bliver kun bedre’
NYHEDER
Celtic vrager Kasper Schmeichel
Ny hooliganpakke er vedtaget